建水土主廟是建水“古建筑博物館”中較有特點的早期建筑之一。土主廟始建于明正統(tǒng)七年（公元1442年），有兩進完整院落，現存山門、正殿、后殿、四廂、六耳共計39間，占地3200平方米。土主廟的建筑風格保持了明代營造法式特征，呈現出明代簡潔、典雅的裝飾風格，是建水古建筑中原汁原味保存的明代彩繪藝術信息的充分展示，也是建水古建筑彩繪藝術的珍貴資料。2003年12月18日，建水土主廟被公布為第六批省級文物保護單位。

2019年10月7日，建水土主廟入選第八批全國重點文物保護單位名單。